O Museu de Arqueologia da Faculdade de Letras e Ciências Sociais da resulta da pesquisa arqueológica desenvolvida no país, sobretudo, no período pós-independência. Essa pesquisa tinha como foco temático tanto os vestígios materiais sobre a ocupação humana em Moçambique desde caçadores e recolectores até a presença das populações de origem Bantu, como as evidências das primeiras sociedades complexas e urbanas antes e durante a presença europeia.